Toute l’équipe est mobilisée pour stopper un terroriste projetant d’utiliser un gaz neurotoxique dans une réserve d’eau de Los Angeles.

De l’argent et des médicaments d’une valeur de 50 millions de dollars, destinés à l’aide humanitaire en Zambie, sont volés. Les membres du FBI s’aperçoivent qu’ils ne sont pas les seuls à vouloir récupérer cette cargaison. Don et Liz envisagent de révéler leur relation amoureuse…

Don enquête sur une série d’explosions visant des responsables de recherches sur les biotechnologies. Les suspects sont un professeur émérite et son élève ingénieur militaire sous les barreaux depuis ses dernières activités terroristes. Le FBI sollicite Charlie pour déterminer le fabriquant des bombes et la prochaine menace. Seulement, sur cet épineux dossier, les frères sont en désaccords sur le véritable responsable de ces violences.

Dans le couloir de la mort d’une prison fédérale, les membres d’un ancien gang tuent un détenu, un repenti qui a confessé ses crimes. Très vite, Don pressent que le mobile ne se limite pas au règlement de comptes mais cache une affaire bien plus complexe…

Une ancienne collègue de Charlie lui demande son aide suite aux décès soudains de certains de ses collègues. Mais quand elle meurt à son tour, Don et Charlie se lancent sur une piste qui pourrait menacer la démocratie qu'ils ont juré de protéger...

Charlie partage son génie entre la résolution d'un crash aérien et le cambriolage de sa maison.
Les frères Eppes se rendent sur les lieux d’un crash d’avion transportant les cadres d’une société spécialisée dans la technologie de défense. L’enquête révèle que l’avion transportait le prototype d’un nouveau lance-missile, mais aussi que l’ordinateur de vol était piégé, ce qui amène le FBI à soulever une bien plus vaste affaire…

David Sinclair finit par arrêter l’un de ses amis d’enfance du Bronx, devenu boxeur, dont deux rivaux sont décédés par l’ingestion d’un poison mortel. C’est la première fois que David revoit Ben, en froid depuis la mort de leur ami commun dix ans auparavant.

Le fils d’un producteur de musique rap et ancien membre d’un gang de Los Angeles est enlevé en plein jour. Pendant que Don s’entretient avec le psychologue du FBI, son équipe joue un contre la montre. L’équipe, dirigée par Megan, dispose d’une heure pour déjouer le plan des ravisseurs, exigeant une rançon faramineuse.

Plusieurs restaurants sont attaqués par des hommes armés qui volent les sacs et les portefeuilles des clients. La police, qui surveille les endroits à risque, perd deux de ses agents lors d'un de ces braquages. Le FBI découvre que les assaillants seraient des mercenaires à Los Angeles pour retrouver un ancien général de l'armée mexicaine protégeant trois enfants de ces tueurs.

La découverte, dans un terrain vague, de la plaque d'un policier présumé disparu mène Don et son équipe à se pencher sur cette disparition datant de 17 ans. Des fouilles mettent effectivement à jour le corps de l'Agent Everett, qui a été tué avec son arme de service. Les soupçons se portent immédiatement sur un ex-chef de gang, qui avait juré la perte d'Everett deux semaines seulement avant le meurtre, après la mort de son frère.